L’architettura del Programma LLP si completa con il Programma trasversale, incentrato su obiettivi non legati ad un singolo settore dell’istruzione e della formazione ma all’intero processo dell’apprendimento permanente. E’ quindi una sorta di ponte sui quattro “pilastri”, i programmi settoriali Comenius, Erasmus, Leonardo e Grundtvig ed ha una funzione di collegamento e complementarietà, per rispondere all’ esigenza di sostenere le attività finalizzate a raggiungere gli obiettivi politici dell’LLP. In questo senso, il programma trasversale si sviluppa nel campo delle lingue e delle TIC e mira a rafforzare la diffusione e l’utilizzo dei risultati del programma.

- promuovere la cooperazione europea in settori relativi a due o più sottoprogrammi settoriali;
- promuovere la qualità e la trasparenza dei sistemi di istruzione e formazione degli Stati membri.

Gli obiettivi operativi del programma trasversale sono i seguenti:

Attività chiave 1: Politiche di cooperazione e innovazione
Supporto alla cooperazione per la definizione di politiche europee nel campo dell’apprendimento permanente e ad attività di osservazione e analisi volte a produrre studi comparativi utili al monitoraggio dei progressi verso gli Obiettivi di Lisbona, i Processi di Bologna e di Copenhagen. Questa attività si sviluppa tramite: 

-  progetti multilaterali e reti tematiche, al fine di proporre buone prassi o elaborare proposte politiche;
-  attività di osservazione ed analisi, tramite studi, ricerche comparate, indagini statistiche. Il principale strumento d’informazione sui sistemi educativi ed i processi di riforma nei sistemi europei è rappresentato da Eurydice, una rete presente in Europa dal 1980;
-  visite di studio in Europa per responsabili delle decisioni in materia d’istruzione;
-  le reti di organizzazioni che agevolano la mobilità ed il riconoscimento delle qualifiche e delle competenze come l’iniziativa Europass, un portfolio europeo che certifica certificare le competenze ed abilità.

Attività chiave 2: Lingue
Promozione dell’apprendimento delle lingue e della diversità linguistica, con progetti finalizzati alla realizzazione di materiali, corsi di formazione e strumenti didattici di qualità.

Attività chiave 3: Nuove tecnologie
Sviluppo di contenuti e soluzioni pedagogiche a carattere innovativo basati sulle nuove tecnologie dell’informazione e della comunicazione, viste come un catalizzatore di cambiamento ed innovazione educativa e sociale.

Attività chiave 4: Disseminazione e utilizzo dei risultati
Diffusione e utilizzo dei risultati delle azioni sostenute nell’ambito del Lifelong Learning Programme e dei programmi correlati e lo scambio di buone prassi. 

La gestione delle candidature per visite di studio è svolta dall’Agenzia LLP.

Le altre attività del Programma Trasversale sono interamente gestiti dalla Commissione europea, tramite l'Agenzia Esecutiva per l'Educazione, la Cultura e l'Audiovideo.